A tudomány számára ismeretlen géneket tartalmazó vírust fedeztek fel Brazíliában

A tudomány számára ismeretlen géneket tartalmazó vírust fedeztek fel Brazíliában
A tudomány számára ismeretlen géneket tartalmazó vírust fedeztek fel Brazíliában
Anonim

A tudósok felfedeztek egy új vírust Brazíliában, amelynek DNS -e a tudomány számára ismeretlen gének 90 százaléka. A felfedezés eredményeit a bioRxiv preprint oldalán teszik közzé.

A vírust a brazíliai Belo Horizonte város Pampulha mesterséges tavában észlelték. Nem túl összetett genomja szinte teljes egészében a tudomány számára ismeretlen génekből áll. A szerzők az új vírust Yaravirus brasiliensis néven nevezték el a dél -amerikai népek mitológiájából származó Yara vízi nimfáról.

A tudósok azt feltételezik, hogy először találkoznak ismeretlen izolált víruscsoporttal, vagy egy óriási vírus távoli fajával, amely kisebb formává fejlődött.

Csak a 21. században fedezték fel, az óriási vírusok mérete eléri a baktériumsejtek méretét. Nevüket hatalmas kapszidjaik miatt kapták - a virionokat tömörítő fehérjemembránok - vírusrészecskék miatt. Rendelkeznek megfelelő hosszúságú DNS-sel is, amely meghaladja a 200 ezer bázispárt, és gyakran tartalmazza az úgynevezett árva vagy árva géneket (ORFan), amelyek más organizmuscsoportban nem találhatók meg.

A komplex genomok lehetővé teszik az óriási vírusok számára, hogy fehérjéket szintetizáljanak, és ezért DNS -javítást, replikációt, transzkripciót és transzlációt végeznek. Felfedezésük előtt azt hitték, hogy a vírusoknak nincsenek ilyen képességeik, mivel inert lények, amelyek csak a gazdájukat képesek megfertőzni. Minden ismert óriási vírus az amőbák parazitája.

És bár az új mikroorganizmus mérete lényegesen kisebb, mint az óriásvírusoké - körülbelül 80 nanométer -, az amőbákon is élősködik, és a genomja szinte teljesen árva: 68 génje (több mint 90 százaléka) nem talál analógot bármely ismert organizmus, és csak hat halványan hasonlít a tudomány által ismert szervezetekre.

"Ez azért van, mert a vírus az amőb vírus új törzse, csodálatos eredettel és filogenetikával" - mondta a tanulmány egyik vezetője, Jônatas Abrahão, a brazil Minas Gerais Szövetségi Egyetem munkatársa.

A tudósok több mint nyolc és félezer metagenómát elemeztek, de nem találtak közöttük az új mikroorganizmushoz kapcsolódó vírusokat. E csoport többi vírusához hasonlóan kettős szálú DNS képviseli, amelynek hossza 44 900 bázispár, és 74 kódoló fragmenst tartalmaz.

"A szokásos protokollok használatával a legelső genetikai elemzésünk nem volt képes felismerhető kapszidszekvenciákat vagy más klasszikus vírusgéneket kimutatni a yaravirusban"-magyarázza Yonatas Abrajao és a tanulmány második vezetője, Bernard La Scola, a francia Aix-Marseille Egyetem munkatársa.

A hivatalos metagenomiai protokollok szerint a yaravirust még csak nem is lehet vírusos szerként felismerni, mert nincs egyértelmű hasonlósága velük. A tudósok még nem tudják megmondani, mi is ő valójában - egy teljesen új csoport képviselője vagy egy óriási vírus leszármazottja, amely valahogy kisebb formává fejlődött.

"Az ismeretlen fehérjék száma, amelyek a yaravirus részecskéit alkotják, tükrözi a vírusvilágban létező változékonyságot, és azt, hogy hány új vírusgenomot kell még felfedezni" - fejezik be a szerzők.

Ajánlott: