Korábban ismeretlen szarbekovírust fedeztek fel az Egyesült Királyság denevéreiben

Korábban ismeretlen szarbekovírust fedeztek fel az Egyesült Királyság denevéreiben
Korábban ismeretlen szarbekovírust fedeztek fel az Egyesült Királyság denevéreiben
Anonim

A tudósok felfedezték az új RhGB01 szarbekovírust, miután csak 53 patkánydenevér ürülékmintáját vizsgálták meg, bővítve a koronavírusok, például a SARS-CoV és a SARS-CoV-2 földrajzi és fajtartományát. Feltehetően a Rhinolophidae teljes tartományában megtalálhatók - Ausztráliától és Japántól Európáig és Afrikáig.

Több mint egy évvel később, a jelenlegi koronavírus -járvány forrása még mindig ismeretlen, annak ellenére, hogy több ezer tanulmány, WHO jelentés, vizsgálat és egyebek vannak. A patkó denevéreket (Rhinolophus) természetes gazdaszervezetnek tekintik mind a SARS-CoV (2002-ben kialakult súlyos akut légzőszervi szindróma), mind a SARS-CoV-2 esetében, de nem találtak köztes hordozót, amely a vírust emberre továbbította volna.

A denevérek tartománya az Óvilág nagy részét lefedi, de a minták nagy részét korábban Kelet- és Délkelet-Ázsiában vették: ott körülbelül 50 SARS-hez kapcsolódó koronavírust találtak tíz denevérfajban, amelyek közül 48 kilenc különböző patkó denevérek. Az új szarbecovírusok-azaz a SARS-hoz társuló koronavírusok-filogenezisének elemzése Kínában azt mutatta, hogy ezek a legszorosabb kapcsolatban állnak a SARS-CoV-vel és a SARS-CoV-2-vel.

A kelet -angliai egyetem tudósai úgy döntöttek, hogy kiegészítik ezeket az adatokat. A Scientific Reportsban tegnap megjelent tanulmány szerzői tucatnyi kis patkó alakú állat ürülékét gyűjtötték össze Somersetben, Monmouthshire-ben és Walesben 2020 augusztusában és szeptemberében. Az állatokat csapdák vagy hálók segítségével fogták el, amelyek közel voltak az erdőkhöz és az erdőkhöz.

Az ürüléket RNS -stabilizáláshoz RNAlater oldatot tartalmazó, egyedi steril csövekbe helyeztük, lehűtöttük és fagyasztva tároltuk az elemzés előtt. A tudósok ezt követően elvégezték a genomszekvenálást, amely 53 minta egyikében azonosított egy korábban ismeretlen vírust. RhGB01 volt a neve. A vírus 10 kódoló gént tartalmaz, míg a SARS-CoV és a SARS-CoV-2-11 kódoló gént, az ORF8 fehérje bevonásával.

„A tüskefehérje és a nukleotidszekvenciák filogenezise kimutatta, hogy az RhGB01 monofiletikus kládban kombinálódik a BM48-31 / BGR / 2008, a Blasius patkó denevér-szarbekovírussal (Rhinolophus blasii), amelyet 2008-ban fedeztek fel Bulgáriában. Az RhGB01 eltér a SARS-CoV és SARS-CoV-2 patogén humán béta-koronavírusokat tartalmazó kládoktól, de szorosabban korrelál a súlyos akut légúti szindrómával járó koronavírussal”-írják a tudósok.

A SARS-CoV és a SARS-CoV-2 szervezetbe való behatolásának fő receptora továbbra is az ACE2 enzim marad, ezt a lehetőséget a receptor-kötő motívum (RBM) biztosítja számára. S -fehérje - ez képezi a vírus burkát. Az új RhGB01 68% -os és 67% -os aminosav-azonosságot mutat az RBD SARS-CoV és a SARS-CoV-2 sejtekkel, de csak 43% és 48% hasonló hozzájuk az RBM-ben. Összehasonlításképpen: a SARS-CoV-2-hez, a denevérekhez és a pangolinokhoz kapcsolódó legközelebbi vírusok 89% -ban és 86% -ban egybeesnek az RBD SARS-CoV-2-vel és 75, 77% -ban a SARS-CoV-vel. Ezenkívül az RhGB01 kevés hasonlóságot mutat a Közel -Kelet Légúti Szindróma Vírussal (MERS). Azonban nincs további furin hasítási helye az S1 és S2 fehérjék találkozásánál, ami a SARS-CoV-2-re specifikus.

„A SARS-CoV és a SARS-CoV-2 receptor-kötő doménjével összehasonlítva a hasonlóság alacsony szintje, az érintkezési maradékok hiánya és a szerkezeti különbségek nagy valószínűséggel azt jelzik, hogy nem tudnak kötődni az ACE2-hez. Ezért az RhGB01 nem valószínű, hogy zoonózisos, ha nem mutálódik. De in vitro vizsgálatok szükségesek ahhoz, hogy kísérletileg megerősítsék az ACE2 -hez vagy más receptorokhoz való kötődés hiányát az emberi sejtekben, és meghatározzák a más emlős ACE2 receptorokhoz való kötődés képességét” - jegyezte meg a tanulmány szerzői.

Bár úgy tűnik, hogy az RhGB01 évezredek óta létezik, a tudósok úgy vélik, hogy érdemes megerősíteni a patkós denevérek koronavírusainak megfigyelését azok teljes terjedelmében, valamint más denevérfajok tekintetében. Végül is mind a SARS-CoV, mind a SARS-CoV-2 feltehetően a mutáció, a homológ rekombináció (a nukleotidszekvenciák cseréje két hasonló vagy azonos kromoszóma között) és legalább egy köztes gazdaszervezeten keresztül alakult ki.

Vagyis a természetes gazda vírus-elődje genetikai adaptációt kapott, amely lehetővé tette az emberek sikeres megfertőzését és a köztünk történő továbbítást. És ahol lehetőség van a szarbecovírusok homológ rekombinációjára az együttfertőzés révén, ott fennáll az új zoonózisok veszélye.

„Bármely denevér, amely SARS-szerű vírust hordoz, mutációk üstjévé válhat. És ha egy RhGB01-es denevér megfertőződik SARS-CoV-2-vel, fennáll annak a veszélye, hogy ezek a vírusok hibridizálódnak-és megjelenik egy új, amely már képes lesz megfertőzni az embereket”-fejezték be a kutatók.

Ajánlott: